Siedziba Muzeum Regionalnego mieści się w zabytkowym budynku z końca XVIII w tzw. Opatówce – byłym domu opata cystersów wągrowieckich. Podczas prac remontowych zachowano (z niewielkimi zmianami) architekturę budynku oraz dawny układ pomieszczeń. Zbiory liczą ponad 3500 muzealiów.

Obok gromadzenia zbiorów muzeum organizuje  wystawy stałe i czasowe oraz różne formy działalności popularyzatorskiej i edukacyjnej, z których korzystają  mieszkańcy miasta i powiatu, od przedszkolaków do seniorów. Dla zainteresowanych grup oraz osób indywidualnych muzeum zapewnia przewodnika po zabytkach miasta i okolic.

Wśród imprez muzealnych najważniejszym corocznym wydarzeniem od 1998 roku są Wągrowieckie Festyny Cysterskie. Ta dwudniowa impreza cieszy się nie tylko ogromną popularnością wśród mieszkańców Wągrowca i okolic, ale ma także swoich fanów z różnych  stron kraju i zagranicy.