W 2009 roku podczas uroczystości odpustowej Stygmatów św. Franciszka w trzydziestą rocznicę pielgrzymki Ojca Świętego postawiono pamiątkowy kamień. Tablica na pomniku przypomina o pierwszej wizycie Jana Pawła II w ojczyżnie. W 1966 roku papież - jeszcze jako Metropolita Krakowski - w rocznicę 350-lecia istnienia oo. Bernardynów w Alwerni odwiedził klasztor. Kamień, ofiarowany przez kopalnię z Chrzanowa, stoi w pobliżu świątyni.