Kościół franciszkański znajduje się na Wzgórzu Panieńskim. Franciszkanie przybyli tu w 1259 r., sprowadzeni przez księcia kalisko-gnieźnieńskiego Bolesława Pobożnego oraz jego małżonkę, błogosławioną Jolentę. Gotycki kościół wzniesiono w latach 1270-1279. Po pożarze z 1613 r. świątynię przebudowano w stylu barokowym. W 1836 r. nastąpiła kasata zakonu franciszkanów. Powrócili oni do Gniezna w 1928 r. i odzyskali kościół, który w latach 1930-32 został regotyzowany. Zabytek ma dziś barokowy wsytrój wnętrza. Znajdują się tu m.in. relikwiarz bł. Jolenty i obraz Matki Bożej ,,Pani Gniezna''.