Istnienie wsi Sąpolno i kościoła w niej potwierdzają dokumenty krzyżackie z 1326 r. Świątynia ta istniała do początku XVII w. (czasowo przejęta przez protestantów), gdy wybudowano nową. Ów drugi kościół jako opustoszały i porzucony rozebrano w 1817 r. Od tego czasu katolicy z Sąpolna korzystali z kościoła w Konarzynach. Gdy w 1920 r. granica polsko-niemiecka oddzieliła parafian od ich świątyni (Sąpolno przeniesiono wtedy do parafii w Przechlewie) podjęto decyzje o budowie nowej. Ukończono ją i poświęcono w 1934 r.