Szkoła Katedralna powstała w drugiej połowie XVI wieku jako filia Akademii Krakowskiej. Budynek został wybudowany według projektu włoskiego architekta Andrzeja Bononiego. Przebudowana została w XVIII wieku. Na elewacji budynku znajduje się malowidło, które przedstawia Matkę Boską z dzieciątkiem, które pochodzi z XVIII wieku. Obecnie dobiegają końca prace rewitalizacyjne obiektu. Część prac została sfinansowana z Funduszy Europejskich. Obecnie w budynku znajduje się Muzeum Archidiecezjalne.