Wyższe Seminarium Duchowne znajduje się przy ulicy Zamkowej 5. Utworzone zostało 6 lutego 1687 roku przez biskupa Jana Stanisława Zbąskiego. W 1688 roku został wzniesiony piętrowy budynek, a następnie kaplica pod wezwaniem świętego Karola Boromeusza. Budynek seminaryjny był kilkakrotnie przebudowywany. W latach 1724-34 został rozbudowany przez biskupa Aleksandra Fredrę. W 1783 roku seminarium zostało zlikwidowane przez władze austriackie. Dzięki usilnym staraniom władz kościelnych władze zaboru austriackiego w 1792 roku zezwoliły na otwarcie Seminarium Duchownego w Przemyślu. Faktycznie swoją działalność rozpoczęło ono dopiero w 1819 roku. W czasie pierwszej wojny światowej seminarium zostało zamknięte i przekształcone na szpital wojskowy. W okresie drugiej wojny światowej zostało przeniesione przez biskupa Franciszka Bardę do willi „Anatolówka” w Brzozowie. Po wyremontowaniu budynków Seminarium Duchowne w Przemyślu wznowiło swoją działalność w 1946 roku.