W rezerwacie Zimne Wody występuje charakterystyczna dla Ponidzia roślinność stepowa. Podobne zgrupowania roślinności stepowej zobaczymy w Skorocicach, Chotlu Czerwonym oraz na wzniesieniach ponad doliną Nidy. Charakterystycznymi roślinami dla tego typu stepu są tutaj: macierzanka, ostnica włosowata, dziewięćsił bezłodygowy, miłek wiosenny, mikołajek płaskolistny, ostrołódka kosmata, dzwonek syberyjski, sasanki, pierwiosnki, kostrzewa bruzdkowana. Wszystkie one, oraz wiele innych ciekawych i rzadkich gatunków, są objęte ochroną.