Muzeum powstało w 2001 r. na bazie zbiorów Izby Pamięci Narodowej Zespołu Szkół Rolniczych w Głubczycach oraz Muzeum Ziemi Głubczyckiej, mieszczącego się od 2000 r. w tej samej szkole. Działa na podstawie statutu zatwierdzonego przez Ministerstwo Kultury i Dziedzictwa Narodowego. Już od jesieni 2008 r. będzie można podziwiać zbiory muzeum w nowej siedzibie - odbudowanym głubczyckim ratuszu. Dostępne są ekspozycje: historyczna i etnograficzna. W ramach tej pierwszej prezentowane są zabytki prezentujące dzieje ziemi głubczyckiej od czasów prehistorycznych do 1945 r., związane z ludnością polską, niemiecką, morawską i żydowską zamieszkującą tutejszy powiat. Godne uwagi są eksponaty odnoszące się do głubczyckiego browarnictwa, a także pochodzące z okresu plebiscytowego na Górnym Śląsku oraz I i II wojny światowej, a w szczególności: broń, hełmy, elementy wyposażenia żołnierzy różnych armii, dokumenty i fotografie. Część pamiątek pochodzi z wykopów na terenie powiatu głubczyckiego, gdzie w marcu i kwietniu 1945 r. toczyły się krwawe walki niemiecko-radzieckie. W ramach ekspozycji etnograficznej prezentowane są przedmioty użytku domowego, odzież, narzędzia pracy w zagrodzie i na roli. Część z nich służyła niemieckim gospodarzom, część po zakończeniu II wojny światowej przywieźli ze sobą polscy gospodarze z Kresów Wschodnich.