Młyn usytuowany jest w pobliżu murów klasztornych nad stawem i dawnym kanałem młyńskim. Pierwotnie należał do księcia strzeleckiego Alberta. 17.04.1361 r. książę podarował go jemielnickim cystersom, którzy z kolei dzierżawili go młynarzom i z tego czerpali korzyści. W nocy 12 maja 1662r. młyn klasztorny spłonął, ale szybko został odbudowany i latem 1662 roku ponownie został uruchomiony.

Po skasowaniu zakonu cystersów w 1810 r. został prawdopodobnie przejęty przez wadze pruskie po czym został przejęty przez parafię. Z powodu nierentowności młyna w 1937 r. ówczesny ksiądz Sylwester Bacia kazał przebudować obiekt na dom wielorodzinny.

Z okazji 750 lecia Jemielnicy na elewacji dawnego młyna umieszczona została pamiątkowa tablica. Obok młyna wzniesiony został kilkukondygnacyjny spichlerz. Obiekt wzniesiony na planie prostokąta z małymi, prostokątnymi otworami w elewacji.