Historia parafii p.w. Miłosierdzia Bożego w Kudowie-Zdroju sięga 1972 roku, kiedy to za zgodą Urzędu ds. Wyznań we Wrocławiu, ordynariusz ks. arcybiskup Bolesław Kominek erygował w miejsce samodzielnego wikariatu nową parafię przy kaplicy Najświętszego Serca Pana Jezusa. Obecny kościół wybudowany został na początku lat dziewięćdziesiątych XX wieku. Pierwsza msza święta została odprawiona dnia 4 czerwca 1995 roku.