Miejscowość Wielkie Czyste położona jest w powiecie chełmińskim, w gminie Stolno, ok. 8 km na południe od Chełmna, 1 km w bok od drogi krajowej nr 91 (dawna jedynka). Gotycki kościół w Wielkim Czystym wzniesiony został w 1246 r., wezwanie św. Katarzyny nosi od 1667. W wiekach średnich patronat nad nim sprawowały najprawdopodobniej cysterki, a następnie benedyktynki z Chełmna.

Orientowana świątynia stoi na niewielkim wzniesieniu, zbudowana jest z kamieni polnych i nadbudowana cegłą. Budowla była wielokrotnie odnawiana: w 1546, 1651, 1657 po uszkodzeniu i ograbieniu przez Szwedów w czasie "potopu" i w 1877 r. Po pożarze, który miał miejsce w 1914 r., kościół odbudowano w 1925, dobudowując prezbiterium i zakrystię. Wystrój i wyposażenie wnętrza świątyni pochodzi z przełomu XVII i XVIII w.

Kościół pw. św. Katarzyny w Wielkim Czystym wpisano do rejestru zabytków 25.05.1984 r.