Kościół św. Andrzeja Boboli został wybudowany w stylu modernistycznym w 1928 r., jego budowa trwała tylko jeden rok.

Jest to budowla dwupoziomowa z wysoką wieżą, kryta dachem dwuspadowym. Projekt świątyni wykonał szczeciński architekt Adolf Thesmacher. Przed wojną należała ona do kościoła ewangelickiego (luterańskiego), pierwszym pastorem był J. Ahnke. W kwietniu 1945 prezydent Szczecina Piotr Zaremba wystąpił do abpa Walentego Dymka o zapewnienie obsługi duszpasterskiej osadnikom polskim. Poświęcenie odbyło się 1 października 1945. W ciągu roku kościół został odbudowany ze zniszczeń wojennych. W 1952 nastąpiło poświęcenie kościoła dolnego – przeznaczonego głównie dla obsługi duszpasterskiej dzieci i młodzieży.

Podczas stanu wojennego kościół był ważnym ogniwem dystrybucji pomocy zagranicznej, a wielu parafian trafiło do obozów internowania. W 1989 odsłonięto pamiątkową tablicę poświęconą podziemnej Solidarności na terenie Szczecina. Przed kościołem znajduje się pomnik św. Andrzeja Boboli.