Drugą najliczniejszą wspólnotę protestancką dawniej Zduńskiej Woli stanowili baptyści, liczący dziś zaledwie kilkanaście osób. Baptyści przybyli do Zduńskiej Woli już w 1868 roku. Pierwsze nabożeństwo zostało odprawione w roku 1869 przez misjonarza. W 1870 roku odbył się pierwszy w Zduńskiej Woli chrzest według obrządku baptystów. W latach 1903-1903 wzniesiono nowy obiekt przy ulicy Dąbrowskiego.

W czasie II wojny światowej, mimo ogólnie złej sytuacji, zduńskowolscy baptyści mieli się całkiem dobrze. Latem 1941 roku, na bramie wejściowej do kościoła pojawił się niemiecki napis, podobnie jak na bramie miejscowego kościoła ewangelickiego, "FŰR POLEN VERBOTEN" (Polakom wstęp wzbroniony). Po wyzwoleniu Zduńskiej Woli parafia przestała istnieć. W 1945 r. obiekt przydzielono Komendzie Hufca ZHP, który użytkowała przez kilka lat. Po latach, w 1990 r. zwrócono baptystom ich świątynię, po czym utworzyli oni własną parafię.