Intensywny rozwój gospodarczy Wielkopolski w drugiej połowie XIX i na początku XX wieku spowodował potrzebę rozbudowy sieci komunikacyjnej, zarówno drogowej, jak i kolejowej. Powstała wówczas dość gęsta sieć linii. Jedna z nich połączyła w 1901 roku Kościan z Grodziskiem Wielkopolskim. Po wyjeździe z Kościana pociągi zatrzymywały się na pierwszej stacji znajdującej się w Bonikowie. Dla obsługi ruchu kolejowego zbudowano tutaj budynek stacji według wspólnej koncepcji dla wszystkich przystanków linii.

Budynek stacji w Bonikowie składa się z piętrowej części środkowej oraz dwóch parterowych skrzydeł bocznych. W jednym skrzydle mieściły się kasa i dyspozytornia, natomiast drugie w całości zajmował magazyn.

Od zamknięcia połączenia kolejowego w latach 90. XX wieku budynek stacyjny pełni funkcje mieszkalne.