Parafia Miłosierdzia Bożego jest najmłodszą w Grodzisku Mazowieckim. Powstała z inicjatywy ks. prałata Lucjana Rutkowskiego.

1 grudnia 1983 roku została zatwierdzona lokalizacja nowego kościoła. Całe procedury związane z wykupem ziemi trwały do sierpnia 1986 roku. W dniu 1 kwietnia 1987 roku kardynał Józef Glemp erygował parafię pod wezwaniem Miłosierdzia Bożego. W 1989 roku został wmurowany kamień węgielny pod budowę nowej świątyni przez biskupa Władysława Moziołka. Kościół zaprojektował architekt mgr inż. Andrzej Wolff.