Cmentarz żydowski znajduje się przy drodze wylotowej do Kielc, na zboczu Góry Miejskiej.

Do roku 1866 wyznawcy judaizmu z Bodzentyna chowali swoich zmarłych w Szydłowcu. W 1867 roku zatwierdzono granice obecnej nekropolii, a w 1933 ją powiększono. Do dziś zachowało się ponad 70 macew pochodzących z lat 1870-1934.

Teren został uporządkowany w latach 2006-2008 z inicjatywy miejscowego księdza Leszka Sikorskiego i wywodzącego się z Bodzentyna Maksa Manesa Szafira. Akcja wsparta została przez Szwedzki Komitet przeciwko Antysemityzmowi, który dokonał zbiórki funduszy na restaurację nekropolii.

Przy wejściu ustawiono ufundowaną przez ks. Leszka Sikorskiego macewę poświęconą pamięci członków rodziny M. Szafira zabitych w latach Zagłady.