Za Muzeum Tatrzańskim rozciąga się Ogród Botaniczny im. Mariana Raciborskiego zwany potocznie Alpinarium. Jest to najmniejszy ogród botaniczny w Polsce. Pomysł założenia ogrodu zawdzięczamy Stanisławowi Witkiewiczowi i Marianowi Raciborskiemu. Przy dawnej siedzibie muzeum przy ul. Chałubińskiego zasadzili oni kilka okazów flory. Ogród zniszczyła woda. Nowy założono w 1919 roku obok Dworca Tatrzańskiego, jednak po rozpoczęciu budowy Domu Turysty alpinarium przeniesiono na miejsce, w którym znajduje się obecnie. Na niewielkiej powierzchni ogrodu – ok. 3000 m2 – zgromadzono ponad 600 gatunków roślin tatrzańskich należących do 72 rodzin i 290 rodzajów. Można tu podziwiać m.in. szarotkę alpejską, liczne gatunki skalnic, goryczek, skalnicę tatrzańską, ostróżkę tatrzańską, urdzika karpackiego. Rośnie tu 65 gatunków roślin objętych ochroną, a wśród nich szafran spiski, lilia złotogłów, obuwik pospolity. Alpinarium jest miejscem, w którym obejrzeć można gatunki roślin zagrożonych wyginięciem, a czasami nawet takie, które nie występują już w środowisku naturalnym. Podczas wycieczki zwiedzający ogród mogą zapoznać się z roślinnością leśnego dolnego i górnego regla oraz wysokogórską roślinnością muraw, turni i skał, piargów, wyleżysk, ziołorośli i mszarników, charakterystycznych dla piętra halnego i turniowego.