Parafia pw. św. Izydora w Woli Mystkowskiej została erygowana 24 września 1916 roku. Początkowo tutejsi mieszkańcy korzystali z niewielkiej kaplicy zlokalizowanej w zabudowaniach dworskich. Dopiero w latach 1936-1938 z fundacji rodziny Michałowskich zbudowano murowany, stojący do dziś kościół. Świątynia została konsekrowana 24 listopada 1974 roku przez biskupa płockiego Bogdana Sikorskiego i otrzymała wezwanie Najświętszego Serca Jezusowego.