Kościół św. Antoniego Padewskiego przy ulicy Senatorskiej powstał z inicjatywy króla Zygmunta III Wazy jako wotum wdzięczności za zdobycie Smoleńska 13 czerwca 1611 roku. W dniu 4 października 1623 roku odbyło się uroczyste poświęcenie krzyża przez kanclerz koronnego, biskupa kujawskiego Andrzeja Lipskiego, w obecności pary królewskiej, nuncjusza apostolskiego Jana Lancellottiego i wielu dostojników. Konsekracja drewnianej świątyni nastąpiła 13 maja 1635 roku przez biskupa Jana Baltazara Liescha, a opiekę nad nią powierzono ojcom reformatom. W 1657 roku kościół wraz z klasztorem został zniszczony w czasie najazdu szwedzkiego przez wojska Jerzego II Rakoczego. Nowy kościół został wybudowany w latach 1668-80 z fundacji Stanisława Leszczyc-Skarszewskiego, kasztelana wojnickiego, według projektu Józefa Bellottiego jako świątynia jednonawowa w stylu barokowym. W dniu 31 sierpnia 1681 roku nastąpiła konsekracja przez biskupa poznańskiego Stefana Wierzbowskiego. W latach 1734-35 z prawej strony w prezbiterium z polecenia króla Augusta III Mocnego zostało wybudowane oratorium, czyli loża królewska. W latach 1767-81 wzniesiono kaplicę Matki Boskiej, a w 1792 roku do krużganka dobudowano boczne ramiona. W dniu 7 lipca 1867 roku klasztor uległ kasacie, kościół zaś przejęli księża diecezjalni. W 1895 roku została wybudowana kaplica Świętej Rodziny, natomiast w roku 1907 kaplica Najświętszego Serca Pana Jezusa. W czasie powstania warszawskiego kościół został częściowo zniszczony. W 1949 roku arcybiskup Stefan Wyszyński, ordynariusz warszawski i Prymas Polski, opiekę nad świątynią powierzył franciszkanom - reformatom. Odbudowa kościoła przy ulicy Senatorskiej 31/33 została ukończona w 1969 roku. W krużgankach znajduje się wiele XIX-wiecznych tablic zasłużonych mieszczan, m.in. Klementyny Hofmanowej, Stanisława Jachowicza, Franciszka Smuglewicza i Rafała Hadziewicza, a także tablice poświęcone żołnierzom, którzy polegli w czasie II wojny światowej i powstania warszawskiego, jak również zmarłych w obozach koncentracyjnych oraz łagrach rosyjskich.