Kościół wzniesiony na cyplu lessowego wzgórza, w miejscu dawnego grodziska prawdopodobnie w połowie XIII w. przez Pawła z Samborca.Tak wysokie położenie uwarunkowane było również bliskością Wisły, która dawniej swobodnie rozlewała się po rozleglej dolinie.Kościół po zniszczeniach w czasie wojen szwedzkich został odbudowany pod koniec XVII w. i powiększony przez dobudowanie nawy i przekształcenie prezbiterium.

Świątynia w Samborcu to budowla barokowa,murowana z pierwotnego stylu romańskiego zachowała się tylko półkolista absyda zamykająca prostokątne prezbiterium. W 1880 r. dobudowano zakrystię, kruchtę oraz wzniesiono neorenesansową dzwonnicę, budynek plebanii pochodzi z początku lat 30 XX w.