Najstarsza część kościoła w Pączewie powstała za panowania krzyżackiego, w XIV w. Była to nawa z prezbiterium, prostokątna, murowana z kamienia i cegły konstrukcja o wymiarach 17,8 na 7,6 m. W wieku XVI dobudowano czworoboczną wieżę, zaś w XVIII – dwie boczne kaplice.

W kościele zobaczyć można jego barokowe wyposażenie: ołtarz główny z rzeźbiarskim przedstawieniem sceny Zwiastowania (można je zasłonić obrazem o tej samej treści), ołtarze boczne, chrzcielnicę i ambonę. Najstarszy zabytek ruchomy – figura Maryi z Dzieciątkiem – przechowywana jest w muzeum diecezjalnym w Pelplinie.