Wieś karczemna powstała w XVIII wieku na przedmieściu Gniewu. Jest to nazwa humorystyczna typowa dla nazw karczm i osad karczemnych powstałych przy karczmach.

Osady o nazwie Nicponia powstawały najczęściej w sąsiedztwie dawnych grodów. Pierwotne siedlisko wsi było usytuowane w pobliżu osady Nowy Dwór i tzw. Katzerkampe. Wieś rozwinęła się w XIX i XX wieku. Powstało wtedy wiele dużych domów mieszkalnych i usługowych, cukrownia, do której doprowadzono kolejkę wąskotorową. Przez wieś wybudowano drogi bite z Nicponi do Opalenia (1891) i z Bydgoszczy przez Nicponię do Królewca (1824-1830).

W zachodniej części wsi znajdowały się tereny ćwiczeń i strzelnice dla jednostki wojskowej z Gniewu. Od 1922 roku mieszkał w Nicponi gen. Karol Trzaska-Durski (1849-1935). Rozwój terytorialny wsi nastąpił w drugiej połowie XX wieku.